El Minizoológico Educativo está ubicado en la Campiña de Moche, ramal Sun s/n a cien metros a la derecha del camino principal.

Para llegar al Minizoo Educativo en la mañana el paradero se encuentra en la Avenida de los Incas a la altura de Suárez, a una cuadra del mercado Mayorista.

Para llegar al Minizoológico Educativo a partir de las 3 de la tarde el paradero de combis queda entre Atahualpa y La Avenida Los Incas. Son unidades blancas o azules cuya trayectoria atraviesa la Campiña de Moche hasta la Huacas del Sol y la Luna, sin embargo, el Minizoológico queda en la mitad del camino a las huacas. Y el pasaje cuesta 0.80 céntimos.

Un taxi desde el centro hasta el Minizoo cuesta entre 6 y 8 soles.